O Naruto τίθεται σε μια νέα αποστολή. Αυτήν την φορά σκοπός του είναι να πιάσει ένα νιντζα ονόματι Mukade, και ετοιμάζεται να πάει στα ιστορικά ερείπια "Ouran" όπου εκεί θα τον στριμώξει. Στόχος του Μukade είναι να ενεργοποιήσει ένα αδρανοποιημένο αρχαίο περίγλυφο που βρίσκεται στα ερείπια. Μόλις το καταφέρνει, μια δέσμη φωτός στέλνει τον Naruto 20 χρόνια πίσω στον χρόνο και τον φέρνει σε επαφή με τον πατέρα του και Tέταρτο Hokage, Minato Namikaze.