Τα γεγονότα διαδραματίζονται στην Ιαπωνία το έτος 2071 όπου ο κόσμος έχει σχεδόν καταστραφεί παντελώς από μυστηριώδη τέρατα που είναι γνωστά ως Aragami. Μια οργάνωση ονόματι Fenrir δημιουργήθηκε για να εξοντώσει τα Aragami με τη χρήση όπλων που λέγονται God Arcs τα οποία κατασκευάζονται από κύτταρα των Aragami. Αυτοί που ειδικεύονται στην εξόντωση των Aragami ονομάζονται God Eaters.